Politický referát se zabývá všemi oblastmi zahraniční a vnitřní politiky České republiky. Těžiště tvoří bilaterální vztahy mezi Českou republikou a Německem stejně tak s ostatními sousedy, jednání o vstupu do EU a také spolupráce s mezinárodními organizacemi (NATO, Rada Evropy, UNO). Připravuje se souhlasem české strany návštěvy německých politiků na vysoké úrovni v České republice. Vedle toho je těžištěm jeho práce udržování kontaktů se zástupci všech politických sil v České republice.

Vedoucím referátu pro politické záležitosti a zároveň zástupce velvyslance je Konrad Scharinger.

Hospodářské oddělení sleduje politiku hospodářslou, dopravní a životního prostředí a poskytuje spolkové vládě informace vztahující se k hospodářství. Podporuje kontakty mezi vládními místy, spolky a podnikatelskými subjekty z České republiky a Německa a podporuje činnost německých exportérů a investorů. Dále se stará o německé delegace, jejichž těžiště tvoří hospodářskopolitická témata.

Vedoucím hospodářského referátu je Josef Beck.

Právní a konzulární referát je nejdůležitější kontaktní místo pro německé občany trvale žijící v Česku, kteří nespadají do kompetence českých úřadů. Němci, kteří se ocitnou během přechodného pobytu v tísňové situaci, nabízí nejnutnější výpomoc. A konečně příslušným úřadem pro udělování víz za spolkovou republiku platné zpravidla v celkovém rámci působnosti Schengenské úmluvy.

Vedoucí právního a konzulárního referátu je Lydia Daimer.

Kulturní referát velvyslanectví koordinuje zahraniční kulturní a vzdělávací politiku Spolkové republiky Německo v České republice v těsné spolupráci s různými zprostředkovatelskými organizacemi. Ke klíčovým úlohám patří vedle péče o spolupráci s místními nositeli kultury i podpora německého jazyka a sledování svébytné kulturní práce německé menšiny. Oblasti vzdělání, škol, vědy a vysokých škol stejně tak i otázky péče o válečné hroby vytvářejí další pole působení pro kulturní referát.

Vedoucím kulturního referátu je Valentin Gescher.

Tiskový odbor má zodpvědnost za práci s veřejností. Zpracovává otázky medií o Německu ze strany českých novinářů, ale také německých a cizích korespondentů v České republice a informuje o otázkách bilaterálních vztahů na všech úrovních.

Vedoucím tiskového referátu je Sebastian Gerhardt.

Sociální referát se zabývá otázkami aktuálního společenskopolitického vývoje v České republice, pracovněprávními a sociálněprávními vztahy, otázkami zdravotní politiky stejně tak i ženskou a rodinnou politikou. Udržuje kontakty s příslušnými misterstvy, sociálními partnery, nevládními organizacemi a také zástupci z oblast práce s mládeží a církevní politiky.

Vedoucí sociálního referátu je Bernd Felgendreher.

Štáb vojenského přidělence radí velvyslanectví na poli vojensko-politickém, zbrojně-technickém a zbrojařském a podává zprávy o bezpečnostně a vojensko-politických záležitostech. Zastupuje německé vojenské zájmy vůči vojsku České republiky a pečuje o spojení s příslušnými vojenskými a civilními služebnami českého ministerstva obrany a generálního štábu. Je mimo to prostředníkem bilaterálních vzdělávacích a kooperačních aktivit a udržuje kontakty s jinými cizími atašé.

Vojenským přidělencem je Karl-Peter Wernz.