Das politische Referat befasst sich mit allen Feldern der Außen- und der Innenpolitik der Tschechischen Republik. Schwerpunkte bilden die bilateralen Beziehungen zwischen Tschechien und Deutschland sowie den übrigen Nachbarn, die Beitrittsverhandlungen zur EU wie auch die Zusammenarbeit in internationalen Organisationen (NATO, Europarat, UNO). Es bereitet in Abstimmung mit der tschechischen Seite hochrangige Besuche deutscher Politiker in Tschechien vor. Daneben steht die Kontaktpflege zu Vertretern aller politischen Kräfte in Tschechien im Mittelpunkt der Arbeit.

Leiter des Referats für politische Angelegenheiten ist Konrad Scharinger, zugleich Stellvertreter des Botschafters.

Das Wirtschaftsreferat leitet Herr Josef Beck.

Das Rechts- und Konsularreferat ist die wichtigste Anlaufstelle für ständig in Tschechien ansässige deutsche Staatsbürger zur Regelung rechtlicher Fragen, die nicht in die Zuständigkeit tschechischer Behörden fallen. Deutschen, die während eines vorübergehenden Aufenthaltes in eine Notsituation geraten sind, bietet es Hilfe zur Selbsthilfe. Zudem ist es für die Erteilung von Visa für die Bundesrepublik Deutschland zuständig, die in der Regel im gesamten Gültigkeitsbereich des Schengener-Abkommens gelten.

Leiterin des Rechts- und Konsularreferats ist Lydia Daimer.

Das Kulturreferat der Botschaft koordiniert die Auswärtige Kultur- und Bildungspolitik der Bundesrepublik Deutschland in der Tschechischen Republik in enger Zusammenarbeit mit den verschiedenen Mittlerorganisationen. Neben Kontaktpflege zu lokalen Kulturträgern gehört die Förderung der deutschen Sprache und die Begleitung der eigenständigen Kulturarbeit der deutschen Minderheit zu den Kernaufgaben. Die Bereiche Bildung und Schulen, Wissenschaft und Hochschulen sowie Fragen der Kriegsgräberfürsorge bilden weitere Arbeitsfelder des Kulturreferats.

Leiter des Kulturreferats ist Valentin Gescher.

Das Pressereferat der Botschaft ist für die Öffentlichkeitarbeit der Botschaft verantwortlich. Es bearbeitet Medienanfragen zu Deutschland seitens tschechischer Journalisten aber auch deutscher und ausländischer Korrespondenten in Tschechien und informiert über Fragen der bilateralen Beziehungen auf allen Ebenen.

Leiter des Pressereferats ist Sebastian Gerhardt.

Das Sozialreferat ist mit Fragen der aktuellen gesellschaftspolitischen Entwicklung in Tschechien, mit arbeits- und sozialrechtlichen Beziehungen, gesundheitspolitischen sowie frauen- und familienpolitschen Fragen befaßt. Es unterhält Kontakte zu den Fachministerien, Sozialpartnern und Nichtregierungsorganisationen sowie zu Vertretern aus den Bereichen Jugendarbeit und Kirchenpolitik.

Leiter des Sozialreferats ist Bernd Felgendreher.

Der Militärattachéstab berät die Botschaft auf militärpolitischem, wehrtechnischem und rüstungswirtschaftlichem Gebiet und berichtet über sicherheits- und militärpolitische Angelegenheiten der Tschechischen Republik. Er vertritt die deutschen militärischen Belange gegenüber den Streitkräften der Tschechischen Republik und pflegt die Verbindung mit den zuständigen militärischen und zivilen Dienststellen des tschechischen Verteidigungsministeriums und Generalstabs. Er ist außerdem Mittler bei bilateralen Ausbildungs- und Kooperationsaktivitäten und hält Verbindung zu anderen ausländischen Attachéstäben.

Militärattaché ist Oberstleutnant i.G. Karl-Peter Wernz.